Sau khi công trình hoàn thành, ông dựng bia Châu Đốc Tân Lộ Kiều Lương tại núi Sam vào năm 1828. Đây là những đóng góp quan trọng, khẳng định chủ quyền của người Việt trên vùng biên giới Tây Nam thời kỳ đầu triều Nguyễn. 

Với tầm nhìn chiến lược, ông còn chỉ huy dân binh đào kênh nối liền sông Đông Xuyên với Rạch Giá để việc qua lại giữa trấn Vĩnh Thanh và Hà Tiên không còn ngăn cách trong mùa khô hạn. Để tưởng thưởng công lao, vua Gia Long lấy tên ông đặt cho núi Sập là Thoại Sơn và sông Đông Xuyên là Thoại Hà.

Đặc biệt, Thoại Ngọc Hầu còn chỉ huy binh lính đào kênh Vĩnh Tế (Châu Đốc, An Giang). Đây là một trong những kênh đào lớn nhất trong lịch sử Việt Nam thời quân chủ, với chiều dài hơn 87km và phải huy động hơn 80 vạn nhân công thực hiện trong 5 năm (1819-1824). Kênh Vĩnh Tế được xem là công trình mang tính chiến lược, trở thành tấm “lá chắn” vững chắc bảo vệ biên giới quốc gia trước sự dòm ngó của ngoại bang. Kênh Vĩnh Tế trở thành “kỳ quan” từ sức người đầu tiên ở vùng biên giới Tây Nam đất nước.

Thoại Ngọc Hầu mất ngày mùng 6/6/1829 và được an táng tại Lăng Thoại Ngọc Hầu nằm cạnh triền núi Sam (thuộc phường Núi Sam, thành phố Châu Đốc). Để tưởng nhớ công ơn của ông, nhân dân tỉnh An Giang đã lập đền thờ tại phường Núi Sam, thành phố Châu Đốc và tại thị trấn Núi Sập, huyện Thoại Sơn.

Tại lễ tưởng niệm, Phó Chủ tịch UBND tỉnh An Giang Lê Văn Phước khẳng định: Cả cuộc đời Thoại Ngọc Hầu đã hết lòng vì dân vì nước, là người có công khai phá vùng đất Nam Bộ. Những đóng góp của Thoại Ngọc Hầu đã khẳng định chủ quyền của người Việt trên vùng biên giới Tây Nam thời kỳ đầu triều Nguyễn. Đặc biệt là hai con kênh Vĩnh Tế và Thoại Hà đến nay vẫn đóng vai trò quan trọng trong tuyến thủy lộ nội địa vận chuyển hàng hóa, giao thương mua bán, an ninh quốc phòng và góp phần phát triển kinh tế, văn hóa, xã hội cho vùng Châu Đốc, An Giang. 

Phó Chủ tịch UBND tỉnh An Giang nhấn mạnh: Lễ tưởng niệm 195 năm Ngày mất Danh thần Thoại Ngọc Hầu là dịp để Đảng bộ, chính quyền và nhân dân An Giang nói chung, Châu Đốc nói riêng, thể hiện lòng thành kính, tri ân, luôn mãi ghi nhớ công lao của vị tiền nhân mở cõi. Đồng thời, giáo dục truyền thống cao đẹp đạo lý “uống nước nhớ nguồn”, giữ gìn bản sắc văn hóa lịch sử dân tộc, tôn vinh công đức người xưa. Lễ tưởng niệm còn nhằm duy trì, phát huy các giá trị di sản văn hóa, nghi lễ truyền thống, thực hành, trao truyền, từ thế hệ này sang thế hệ khác.